冷冻干燥机这类设备现多用在中药饮片，原料药，天然的蔬菜，脱水蔬菜，生物，食品类，蔬果，化学工业，药物中间体等物料的干燥，其具体的应用步骤有以下几点。

　　1、在应用时，首先要对仪器的各零部件进行的清洁，以便于维持设备的良好状态，及其卫生条件。

　　2、在正式开始应用前，必须要行预冻，以便于达到良好的脱水效果；还需要检查真空泵及其原位型冷冻干燥机玻璃罩的气密性，及其仪器主机与真空泵相互间由绿色的真空管相接处的密封性（能够 涂擦适当真空脂）。

　　3、具体的预冻操作，需要准备低温冰箱，将温度设定到零下40摄氏度，或者是零下80摄氏度后，把准备干燥的物品放置于低温冰箱或液氮中，通常需要四个小时左右，能够 直接从外边进行观察到，物品冰冻结实后，才可进行冷冻干燥的实验，把物品快速挪动到仪器的托盘以内，以确保冷冻干燥效果。

　　4、在进行冷冻干燥机清洁操作的时侯，注意不一样零部件要应用不一样的清洁液进行清洁，通常有机玻璃应用生理盐水进行清洁，不锈钢零部件应用乙醇进行清洁，安瓿瓶需要用超声波清洗机进行清洁。